建设自主的独立商城系统和入驻成熟的电商平台有着各自的优势与劣势，用户需要结合自身实际情况作出适合自身的选择

独立商城系统的优势有：
1、自主性强
使用独立商城系统时用户可以根据自身行业特点对业务流程、促销体系、结算体系、UI风格进行个性化的定制，入驻电商平台则只能使用平台现有业务流程，UI也无法做大规模的改动。对于大多数行业客户来说现有电商平台几乎无法满足自身的使用，建立自主的商城系统几乎是唯一的选择。
2、拥有数据
使用独立商城系统时可以拥有全部的用户、商品、订单、访问量、访问分布等数据信息方便制定推广及运营方案，入驻电商平台则只能获取有限的数据并且迁移数据比较困难。
3、整合资源
使用独立商城系统时可以方便的与企业现有系统相结合，调动并整合内部的一切资源，入驻电商平台则几乎没有这样的整合可能。
4、使用自有品牌
使用独立商城系统时可以使用企业自己的品牌、域名方便进行推广，入驻电商平台最多使用二级域名做多宣传流量都引到平台对自身品牌建设效果有限。

入驻成熟电商平台的优势有：
1、前期投入低
入驻电商平台前期费用比较低有些平台甚至是免费的。相对来说自建电商平台前期费用会比较高包括商城系统的采购、商城系统的开发、服务器采购、开发和运维团队的建设，但是长期来看可能获得的资源会更多。
2、使用成熟电商平台流量
入驻电商平台可以获得平台的流量节省了前期宣传推广成本，但是如果想获得好的排名和更多的展现机会广告费用开销可能会非常大。自建电商平台前期推广可能会比较困难但是获取的用户基本都是有效的长期客户。